Center za krepitev zdravja in obvladovanje kroničnih bolezni: predstojnica Jožica Maučec Zakotnik

• Oddelek za krepitev zdravja: vodja Helena Jeriček Klanšček
• Oddelek za analize zdravja: vodja Ada Hočevar Grom
• Oddelek za kronične bolezni: vodja Pia Vračko
• Oddelek Svit: vodja Dominika Novak Mlakar

Center za sistem zdravstvenega varstva: predstojnik Tit Albreht

Center za nalezljive bolezni in okoljska tveganja: predstojnica Alenka Kraigher

• Oddelek za obvladovanje nalezljivih bolezni: vodja Alenka Kraigher
• Oddelek za zdravstveno ekologijo: vodja Nina Pirnat

Zdravstveno podatkovni center: predstojnica Metka Zaletel

• Oddelek za metodologije in standarde: vodja Darja Lavtar
• Oddelek za zbirke podatkov: vodja Jana Trdič

Center za zdravstveno informatiko: predstojnik Matic Meglič

• Oddelek za razvoj informatike: vodja Matic Meglič
• Oddelek za informacijsko-komunikacijsko tehnologijo: vodja Tomaž Podobnik

Center za laboratorijsko dejavnost, Grablovičeva 44, Ljubljana: po pooblastilu vodja Ivan Eržen

• Oddelek za medicinsko mikrobiologijo: vodja Metka Paragi

Skupne strokovne službe:

• Služba za upravljanje z viri: vodja Vesna Vižintin Šporn
• Služba za raziskovalno dejavnost in vodenje projektov: vodja Sandra Radoš Krnel
• Služba za preskrbo s cepivi: vodja Staša Javornik